Klinika nefrologie je zaměřena zejména na diagnostiku a léčbu glomerulonefritid, renální vaskulitidy, lupusové nefritidy, renální a renovaskulární hypertenzi, amyloidózu ledvin a na dědičné nemoci ledvin. Tradiční jsou i očišťovací metody, od nejstarší hemodialýzy, přes peritoneální dialyzační program a kontinuální metody, prováděné na JIP. Od r. 1987 se rozvíjel program plasmaferetický, ve kterém dominují nemoci nervové a z interních - RPGN, vaskulitidy a hematologické (ITP, AIHA). Velký počet pacientů z chronického dialyzačního programu nejen z Prahy se u nás léčí pro nejrůznější komplikace. Pacienti s akutním selháním ledvin tvoří víc jak 20 % hemodialyzačních výkonů.

Nové metody, významné úspěchy:Účast v mezinárodních projektech (European Vasculitis Study Group, European Renal cDNA Bank), diagnostika mutací u autosomálně dominantních polycystických ledvin a vrozených tubulopatií, léčba pacientů s glomerulopatiemi novými imunosupresivy a biologickou terapií.